Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Supt5hO55201 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Supt5hO55201 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
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