Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pja1O55176 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pja1O55176 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pja1O55176 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja1O55176 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja1O55176 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja1O55176 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja1O55176 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pja1O55176 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms