Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syngr2O55101 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syngr2O55101 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syngr2O55101 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syngr2O55101 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syngr2O55101 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syngr2O55101 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Syngr2O55101 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syngr2O55101 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms