Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn20O55082 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn20O55082 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms