Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SlkO54988 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SlkO54988 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SlkO54988 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SlkO54988 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SlkO54988 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SlkO54988 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SlkO54988 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SlkO54988 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SlkO54988 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SlkO54988 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SlkO54988 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SlkO54988 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SlkO54988 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SlkO54988 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SlkO54988 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SlkO54988 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SlkO54988 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SlkO54988 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SlkO54988 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SlkO54988 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SlkO54988 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SlkO54988 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SlkO54988 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SlkO54988 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SlkO54988 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SlkO54988 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SlkO54988 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SlkO54988 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SlkO54988 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SlkO54988 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SlkO54988 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SlkO54988 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SlkO54988 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SlkO54988 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SlkO54988 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SlkO54988 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SlkO54988 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SlkO54988 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SlkO54988 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SlkO54988 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SlkO54988 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SlkO54988 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SlkO54988 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SlkO54988 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SlkO54988 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SlkO54988 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SlkO54988 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SlkO54988 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SlkO54988 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SlkO54988 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SlkO54988 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SlkO54988 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SlkO54988 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SlkO54988 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SlkO54988 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SlkO54988 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SlkO54988 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SlkO54988 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SlkO54988 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SlkO54988 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SlkO54988 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SlkO54988 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SlkO54988 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SlkO54988 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SlkO54988 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SlkO54988 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SlkO54988 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SlkO54988 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SlkO54988 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SlkO54988 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SlkO54988 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SlkO54988 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SlkO54988 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SlkO54988 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SlkO54988 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SlkO54988 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SlkO54988 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SlkO54988 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SlkO54988 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SlkO54988 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SlkO54988 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SlkO54988 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SlkO54988 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SlkO54988 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SlkO54988 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SlkO54988 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SlkO54988 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SlkO54988 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SlkO54988 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SlkO54988 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SlkO54988 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SlkO54988 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SlkO54988 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SlkO54988 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SlkO54988 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SlkO54988 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SlkO54988 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SlkO54988 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SlkO54988 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms