Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csnk2a2O54833 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms