Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EdaO54693 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EdaO54693 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EdaO54693 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EdaO54693 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EdaO54693 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EdaO54693 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EdaO54693 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EdaO54693 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EdaO54693 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EdaO54693 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EdaO54693 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EdaO54693 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EdaO54693 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EdaO54693 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EdaO54693 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EdaO54693 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EdaO54693 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EdaO54693 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EdaO54693 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EdaO54693 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EdaO54693 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EdaO54693 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EdaO54693 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EdaO54693 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EdaO54693 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EdaO54693 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EdaO54693 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EdaO54693 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EdaO54693 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EdaO54693 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EdaO54693 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EdaO54693 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EdaO54693 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EdaO54693 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EdaO54693 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EdaO54693 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EdaO54693 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EdaO54693 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EdaO54693 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EdaO54693 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EdaO54693 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EdaO54693 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EdaO54693 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EdaO54693 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EdaO54693 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EdaO54693 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EdaO54693 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EdaO54693 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EdaO54693 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EdaO54693 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EdaO54693 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EdaO54693 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EdaO54693 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EdaO54693 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EdaO54693 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EdaO54693 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EdaO54693 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EdaO54693 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EdaO54693 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EdaO54693 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EdaO54693 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EdaO54693 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EdaO54693 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EdaO54693 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EdaO54693 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EdaO54693 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EdaO54693 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EdaO54693 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EdaO54693 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EdaO54693 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EdaO54693 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EdaO54693 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EdaO54693 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EdaO54693 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EdaO54693 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EdaO54693 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EdaO54693 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EdaO54693 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EdaO54693 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EdaO54693 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EdaO54693 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EdaO54693 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EdaO54693 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EdaO54693 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EdaO54693 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EdaO54693 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EdaO54693 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EdaO54693 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EdaO54693 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EdaO54693 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EdaO54693 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EdaO54693 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EdaO54693 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EdaO54693 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EdaO54693 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EdaO54693 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EdaO54693 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EdaO54693 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EdaO54693 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms