Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Rabep1O35551 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rabep1O35551 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rabep1O35551 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rabep1O35551 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Rabep1O35551 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rabep1O35551 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rabep1O35551 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rabep1O35551 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rabep1O35551 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rabep1O35551 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rabep1O35551 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rabep1O35551 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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