Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Edil3O35474 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edil3O35474 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Edil3O35474 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Edil3O35474 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Edil3O35474 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms