Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-ObO35424 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms