Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kpna3O35344 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms