Protein–RNA interactions for Protein: O35242

Nsmaf, Protein FAN, mousemouse

Predictions only

Length 920 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmafO35242 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmafO35242 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmafO35242 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmafO35242 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmafO35242 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmafO35242 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmafO35242 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmafO35242 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmafO35242 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmafO35242 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmafO35242 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmafO35242 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NsmafO35242 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms