Protein–RNA interactions for Protein: O35216

Cenpa, Histone H3-like centromeric protein A, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpaO35216 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CenpaO35216 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CenpaO35216 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CenpaO35216 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CenpaO35216 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CenpaO35216 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CenpaO35216 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CenpaO35216 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CenpaO35216 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CenpaO35216 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CenpaO35216 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CenpaO35216 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CenpaO35216 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CenpaO35216 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CenpaO35216 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CenpaO35216 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CenpaO35216 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CenpaO35216 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CenpaO35216 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CenpaO35216 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CenpaO35216 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CenpaO35216 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CenpaO35216 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CenpaO35216 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CenpaO35216 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CenpaO35216 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CenpaO35216 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CenpaO35216 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CenpaO35216 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpaO35216 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms