Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms