Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MsmbO08540 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MsmbO08540 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MsmbO08540 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MsmbO08540 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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