Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm3239L7N2D9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm3239L7N2D9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm3239L7N2D9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3239L7N2D9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3239L7N2D9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3239L7N2D9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3239L7N2D9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3239L7N2D9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3239L7N2D9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3239L7N2D9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3239L7N2D9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3239L7N2D9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3239L7N2D9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3239L7N2D9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3239L7N2D9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3239L7N2D9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3239L7N2D9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3239L7N2D9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3239L7N2D9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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