Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC117090L7N257 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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BC117090L7N257 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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BC117090L7N257 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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BC117090L7N257 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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BC117090L7N257 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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BC117090L7N257 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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BC117090L7N257 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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BC117090L7N257 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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BC117090L7N257 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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BC117090L7N257 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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