Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20878L7N244 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
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