Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm5564-201ENSMUST00000034916 967 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm15614-201ENSMUST00000155976 1537 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm45299-202ENSMUST00000211011 765 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Ranbp1-201ENSMUST00000052325 923 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm37536-201ENSMUST00000194710 2491 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms