Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccer2J3QPU5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccer2J3QPU5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms