Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20795J3QP49 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20795J3QP49 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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