Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms