Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim15G3UY57 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms