Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Urb2E9Q7L1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Urb2E9Q7L1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Urb2E9Q7L1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Urb2E9Q7L1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Urb2E9Q7L1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Urb2E9Q7L1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Urb2E9Q7L1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Urb2E9Q7L1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Urb2E9Q7L1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Urb2E9Q7L1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Urb2E9Q7L1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Urb2E9Q7L1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Urb2E9Q7L1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Urb2E9Q7L1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Urb2E9Q7L1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Urb2E9Q7L1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Urb2E9Q7L1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Urb2E9Q7L1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Urb2E9Q7L1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Urb2E9Q7L1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Urb2E9Q7L1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Urb2E9Q7L1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Urb2E9Q7L1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms