Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms