Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5C9

Nolc1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nolc1E9Q5C9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nolc1E9Q5C9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms