Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms