Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms