Protein–RNA interactions for Protein: E9Q007

Gm4450, Predicted gene 4450, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4450E9Q007 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Gm4450E9Q007 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Gm4450E9Q007 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Gm4450E9Q007 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm4450E9Q007 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms