Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbf2E9PXF8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbf2E9PXF8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms