Protein–RNA interactions for Protein: E9PVU2

4931429L15Rik, RIKEN cDNA 4931429L15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931429L15RikE9PVU2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931429L15RikE9PVU2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931429L15RikE9PVU2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931429L15RikE9PVU2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931429L15RikE9PVU2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931429L15RikE9PVU2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931429L15RikE9PVU2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931429L15RikE9PVU2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931429L15RikE9PVU2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931429L15RikE9PVU2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
4931429L15RikE9PVU2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931429L15RikE9PVU2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
4931429L15RikE9PVU2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931429L15RikE9PVU2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931429L15RikE9PVU2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931429L15RikE9PVU2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931429L15RikE9PVU2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931429L15RikE9PVU2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931429L15RikE9PVU2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931429L15RikE9PVU2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931429L15RikE9PVU2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931429L15RikE9PVU2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931429L15RikE9PVU2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931429L15RikE9PVU2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931429L15RikE9PVU2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931429L15RikE9PVU2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931429L15RikE9PVU2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931429L15RikE9PVU2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931429L15RikE9PVU2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931429L15RikE9PVU2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms