Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc175E9PVB3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms