Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cngb1E1AZ71 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms