Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm5478D3Z6R0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5478D3Z6R0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5478D3Z6R0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5478D3Z6R0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm5478D3Z6R0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5478D3Z6R0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gm5478D3Z6R0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5478D3Z6R0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gm5478D3Z6R0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Gm5478D3Z6R0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5478D3Z6R0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5478D3Z6R0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5478D3Z6R0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5478D3Z6R0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5478D3Z6R0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5478D3Z6R0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5478D3Z6R0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5478D3Z6R0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5478D3Z6R0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5478D3Z6R0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5478D3Z6R0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5478D3Z6R0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5478D3Z6R0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5478D3Z6R0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5478D3Z6R0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5478D3Z6R0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5478D3Z6R0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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