Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim12cD3Z3L3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim12cD3Z3L3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms