Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm3543D3Z235 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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