Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Kif28pD3YXS5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms