Protein–RNA interactions for Protein: D3YUR1

4930444P10Rik, RIKEN cDNA 4930444P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444P10RikD3YUR1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
4930444P10RikD3YUR1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930444P10RikD3YUR1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms