Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nxpe3B9EKK6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms