Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms