Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apba1B2RUJ5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms