Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H60cB1B213 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H60cB1B213 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H60cB1B213 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H60cB1B213 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms