Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem238A9JSM3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms