Protein–RNA interactions for Protein: A2AMT6

Vmn1r2, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r2A2AMT6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r2A2AMT6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms