Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms