Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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