Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ALCAMQ13740 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms