Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SNX15Q9NRS6 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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