Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms