Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AL731684.1-201ENST00000415530 439 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 BMS1P11-201ENST00000442351 885 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC009244.1-201ENST00000450566 258 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 BMS1P9-201ENST00000457640 885 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC130366.1-201ENST00000526505 1192 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 MIR8082-201ENST00000612488 81 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC018558.4-201ENST00000622153 281 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP117-201ENST00000410175 264 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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